Jest jeszcze szansa na uzyskanie dofinansowania dla projektów zgodnych z celami Priorytetu I i II Programu Transport, których realizacja została zrealizowana w latach 2004-2008. Jest jeden warunek- umowa o dofinansowanie musi być zawarta  do końca 2008 roku.

Do dofinansowania będą kwalifikowały się projekty dotyczące: rozwoju różnych gałęzi transportu ( m.in. modernizacji linii kolejowych czy  dostępu do portów morskich) oraz poprawy bezpieczeństwa na drogach.  Aplikacja do programu powinna obejmować: wypełnienie wniosku o dofinansowanie w Generatorze Wniosków ( dostępnym na stronie www.mf.gov.pl w zakładce Unia Europejska) oraz dostarczenie do Departamentu Funduszy Strukturalnych w Ministerstwie Infrastruktury jego wersji papierowej podpisanej przez beneficjenta. Do wniosku należy dołączyć komplet załączników:

1. dokumentacja środowiskowa dotycząca projektu, w tym wszystkie decyzje administracyjne (Raport oceny oddziaływania na środowisko jeżeli był wymagany w procedurze oceny oddziaływania na środowisko, decyzja środowiskowa, lokalizacyjna, pozwolenie na budowę, deklaracja władz odpowiedzialnych za monitorowanie terenów objętych programem NATURA 2000 (w przypadku braku deklaracji należy dostarczyć kopię wniosku złożonego do odpowiedniego organu wraz z mapką oraz oświadczenie o wpływie projektu na tereny objęte programem Natura 2000). Mogą to być również projekty realizowane na zgłoszenie;
2. mapy, szkice lokalizacyjne sytuujące projekt (sugeruje się mapy w następującym układzie: mapa ogólna - usytuowanie projektu na terenie kraju, ogólny przebieg projektu w regionie, części kraju w skali 1:100 000 lub 1:200 000, szczegółowe usytuowanie projektu w skali 1:25 000);
3. dokumentacja dotycząca udzielonych zamówień publicznych dla wydatków kwalifikowanych (ogłoszenia, SIWZ-y, kopie protokołów z prac KP, korespondencja z oferentami, kopie umów z wykonawcami);
4. studium wykonalności lub inne równoważne analizy ekonomiczno - finansowe. Ich uzupełnienie jest możliwe po zawarciu umowy;
5. dokumenty potwierdzające  prawo do dysponowania gruntem lub obiektami;
6. oświadczenia o zachowaniu celów projektu w ciągu 5 lat po zakończeniu realizacji projektu;
7. oświadczenia o braku możliwości odliczenia podatku VAT w związku ze zrealizowaną inwestycją - jeśli VAT ma być uznany za wydatek kwalifikowany;
8. oświadczenia o nie korzystaniu z dofinansowania/refundacji ze środków Unii Europejskiej przyznanych na lata 2004-2006;
9. wypis z Krajowego Rejestru Sądowego, Ewidencji Działalności Gospodarczej (dotyczy przedsiębiorców).